У 1969 році Dodge Charger було дещо змінено. Зовнішні зміни включали нову решітку радіатора з поділом у центрі та нові задні ліхтарі від дизайнера Harvey J. Winn. Була додана нова лінія обробки під назвою Special Edition (SE). Її можна було замовити окремо або разом із пакетом R/Т, у результаті виходив пакет R/T-SE. У пакеті SE додали шкіряні вставки на передніх сидіннях, хромовані молдинги та дерев'яні вставки на панелі приладів. До списку варіантів було додано люк, але він виявиться дуже рідкісною опцією - приблизно 260 проданих машин. Загальний обсяг виробництва 1969 року становив близько 89199 одиниць. У 1969 році Dodge випустив дві найрідкісніші модифікації Dodge Charger: Dodge Charger 500 і Dodge Charger Daytona.